「六四屠城」後，北京市人民政府及戒嚴部隊指揮部宣佈「北高聯」、「工自聯」、 「北京市民自治聯合會」、「首都知識界聯合會」、「首都各界維憲聯席會」、 「外地赴京高校自治聯合會」等均為非法組織，必須立即自動解散，並設置熱線電話讓市民檢舉。

國家安全部及中國公安部下令全國通緝方勵之夫婦、二十一名學生領袖、 首都知識界二十三名主要成員及工人領袖。各地政府也自行發佈通緝名單， 採取快捕快審的政策，企圖徹底鎮壓運動。

根據勞改管理局的數字，「六四」後的一個月內，全國已有超過二千人被捕， 當然官方的數字不能準確地反映被捕的總人數。一九八九年六月十九日，李鵬、喬石及姚依林等會見首都戒嚴部隊三位「烈士」的親屬時，聲言會繼續大搜捕行動， 以防民運人士「東山再起」。

☆ 被通緝21名學生名單：[現況]
王丹﹑吾爾開希﹑劉剛﹑柴玲﹑周鋒鎖﹑翟偉民﹑梁擎墩﹑王正雲﹑鄭旭光﹑馬少方﹑楊濤﹑ 王治新﹑封從德﹑王超華﹑王有才﹑張志清﹑張伯笠﹑李錄﹑張銘﹑熊煒及熊焱。

☆ 被點名23名知識分子名單：[現況]
方勵之﹑李淑嫻﹑戈揚﹑蘇紹智﹑金觀濤﹑嚴家其﹑鮑彤﹑張顯揚﹑包遵信﹑胡平﹑劉曉波﹑ 陳軍﹑任畹町﹑陳子明﹑萬潤南﹑李洪林﹑戴晴﹑于浩成﹑李澤厚﹑蘇曉康﹑溫元凱﹑劉再復﹑曹思源。