「六四屠城」後，北京市人民政府及戒嚴部隊指揮部宣佈「北高聯」、「工自聯」、「北京市民自治聯合會」、「首都知識界聯合會」、「首都各界維憲聯席會」、「外地赴京高校自治聯合會」等均為非法組織，必須立即自動解散，並設立熱線電話讓市民檢舉。
國家安全部及中國公安部下令全國通緝方勵之夫婦、21名學生領袖、首都知識界23名主要成員及工人領袖。各地政府也自行發佈通緝名單，採取快捕快審的政策，企圖徹底鎮壓運動。
根據勞改管理局的數字，「六四」後的一個月內，全國已有超過2,000人被捕，當然官方的數字不能準確地反映被捕的總人數。6月11日，香港學生姚勇戰在離開上海時被查證人員帶走，關禁了一年才獲釋。
另一方面，「六四屠城」亦激發全球華人群起聲討，各地集會、遊行不絕，痛斥中共殘殺手無寸鐵的市民及學生。
6月6日 國務院發言人袁木和戒嚴部隊司令部代表張工舉行記者招待會，袁木表示戒嚴部隊受傷五千人，市民則有二千人，死亡人數三百，大學生只有二十三人死亡。張工表示部隊進入天安門時，沒有打死一名學生和群眾，更沒有用坦克車、裝甲車壓死或壓傷一個人。
6月7日 戒嚴部隊首次安排國內二十三名記者參觀天安門。
另外，香港市民向北京死難烈士追思的哀悼日，部分學校罷課，商店及工廠罷市、罷工，市民紛紛前往中區無名英雄紀念碑及新華社前的臨時靈堂獻花，弔唁致祭，一片愁雲慘霧。世界其他地區的華僑、留學生亦以最沉痛的心情哀悼愛國的死難者，並示威遊行到中國使館，聲討「鄧李楊集團」的罪行。對「鄧李楊集團」殘酷殺害手無寸鐵的民主人士，各國政府作出了強烈反應，特別是當時的美國總統布殊、英國首相戴卓爾夫人、日本政府、法國外長、澳洲總理、西德政府、泰國政府等毫不留情地譴責中國政府，作出了抵制，並延長中國留學生的居留期，接受變節的中國使館人員的政治庇護。其中駐北京美國大使館，更收留了著名民主人士方勵之夫婦。
6月8日 北京市人民政府和戒嚴部隊指揮部發佈通告，宣佈「北京市高自聯」和「北京市工自聯」是非法組織，並設置熱線電話，讓市民檢舉。
李卓人在北京經三天的調查，寫了悔過書後獲釋，於晚上返港。
6月9日 七軍區分別致函中央表態，堅決擁護中央平息首都反革命暴亂。鄧小平公開露面，接見戒嚴部隊軍長級以上官員。
6月10日 北京市公安部門表示已抓獲四百多名在反革命暴亂中參與打砸搶燒殺的「暴徒」，「高自聯」、「工自聯」的一些頭目已緝捕歸案。
6月11日 公安部向全國公安機關發出通緝令，通緝方勵之、李淑嫻夫婦和六名學生領袖。
6月12日 國家公安部發佈「堅決鎮壓反革命暴亂、制止社會動亂通告」，通告全國緝捕「暴亂分子」，並可不依照正常執法程序抓人及使用武器。
6月13日 國家公安部下令全國通緝二十一名學生領袖，並發表他們的名單及資料。經過連日來的大搜捕，約一千名民運人士被捕。
6月14日 公安部發出通緝三名工人領袖資料。學生領袖楊濤十二日逃到蘭州，十四日被捕。馬少芳五日逃至廣州，於白雲山自首。周峰鎖逃至西安兄長家，被姐姐及姐夫舉報。熊焱在往內蒙的火車上被捕。
6月15日 戒嚴部隊將已剪輯的「新聞片」在中央電視台播放，藉此說明民運是場「反革命暴亂」。上海判處徐國明、卞漢武、嚴雪瑩三人死刑，指他們參加焚燒軍車。學生領袖熊煒在瀋陽開往北京的列車上，由母親交予公安人員。
6月16日 袁木在接受美國廣播公司訪問時，曾就該公司所攝得有關部隊進入天安門時殘殺學生及市民的數千呎影帶，解釋為以現代科技捏造及歪曲事實的真相。
6月17日 北京市中級法院裁定八位市民在六月三日至四日的「暴亂」中毆打士兵、放火燒車的罪名，判處死刑。
6月18日 中國頒布出國的新規定，取消以前的出境簽證，同時新例又訂明在獲得外國使館簽證後，仍要由公安局覆核及申請新的出境簽證，是防止民運人士潛逃出國。
6月19日 北京當局為加強「打擊反革命暴亂」，實行快捕快審，不糾纏細節審判尺度。
6月20日 最高人民法院發出「通知」，要求各地法院嚴懲「反革命暴亂分子」。
6月21日 被裁定罪名成立判死刑的徐國明、卞漢武和嚴雪瑩，經上訴無效，即被公開槍決。
6月22日 北京當局發出通緝令，緝拿首都知識界聯合會七名主要成員。經北京中級法院裁定放火燒車的二十四人罪名成立，判處死刑，上訴無效，即時處決。
6月23日 中共十三屆三中全會在北京舉行。曾在廣場絕食的劉曉波，被指為「煽動學潮」，遭拘留審查。
6月24日 四中全會結束，決定撤銷趙紫陽的黨總書記、政治局常委、軍委副主席等一切職務，並對他進行審查。同時決定提升江澤民為總書記。
6月25日 《人民日報》發表社論，聲稱鬥爭取得勝利。
6月26日 法國呼籲聯合制裁北京政府。
6月27日 江澤民反對自由化，聲稱對知識分子政策不變。
6月28日 香港電視台播放吾爾開希控訴中共血腥鎮壓學運的錄影帶。
6月29日 人大常委會議在京舉行，重申鄧小平講話乃正確的思想指導。
6月30日 北京大舉拘捕改革派知識分子。陳希同向人大常委作「平息暴亂」報告。
☆被通緝21名學生名單：
王丹、吾爾開希、劉剛、柴玲、周鋒鎖、翟偉民、梁擎墩、王正雲、鄭旭光、馬少方、楊濤、王治新、封從德、王超華、王有才、張志清、張伯笠、李錄、張銘、熊煒及熊焱。
☆被點名23名知識分子名單：
方勵之、李淑嫻、戈揚、蘇紹智、金觀濤、嚴家其、鮑彤、張顯揚、包遵信、胡平、劉曉波、陳軍、任畹町、陳子明、萬潤南、李洪林、戴晴、于浩成、李澤厚、蘇曉康、溫元凱、劉再復、曹思源。
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